Este estudo tem como finalidade apresentar os desafios enfrentados nos processos de gestão hospitalar com foco em medicamentos. Serão apresentadas as atividades de maior complexidade operacionais relacionadas à logística, ao controle de estoque e fluxo de pedidos. A metodologia de pesquisa pertinente ao tema que compõe este estudo é de natureza bibliográfica fundamentada em literaturas de trabalhos anteriores que abordaram esse tema e estudo de caso descritivo baseado em entrevistas direcionadas às pessoas envolvidas no processo de Gestão Hospitalar, bem como a visitação técnica ao local de estudo para investigar as conformidades dos processos pesquisados. Constatou-se então que o controle de estoque é imprescindível para que o setor disponibilize todos os medicamentos necessários solicitados pelo corpo clínico contribuindo para que o fluxo do pedido aconteça de forma sinérgica ao atendimento das prescrições suprindo as necessidades do paciente em momentos de demandas extremas.